Un equipo internacional con participación de La Mayora secuencia el genoma del alga Spirogyra
Investigadores del IHSM La Mayora (UMA-CSIC) han participado en la secuenciación del genoma de Spirogyra pratensis, un alga clave para entender cómo las plantas pasaron del agua a la tierra. Su aportación es una plataforma genómica de acceso libre.
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Foto: IHSM La Mayora (UMA-CSIC)
Un equipo científico internacional ha publicado el genoma de Spirogyra pratensis, un alga del linaje evolutivamente más cercano a las plantas terrestres. El trabajo aparece en la revista The Plant Cell y combina la secuenciación del genoma completo con un perfil de la actividad de sus genes a lo largo de su ciclo vital y bajo distintas condiciones de luz y temperatura.
Una ventana al salto del agua a la tierra
Spirogyra pertenece a la clase Zygnematophyceae, un grupo de algas estreptófitas que posee herramientas celulares y moleculares relacionadas con la transición del agua a la tierra durante la evolución vegetal. Según los responsables del estudio, estos datos ayudan a reconstruir ese paso.
Una plataforma abierta para la comunidad científica
Dos investigadores del Instituto de Hortofruticultura Subtropical y Mediterránea La Mayora (IHSM La Mayora, UMA-CSIC), Enrique López Gómez y Noé Fernández Pozo, han participado en el trabajo. Su contribución ha sido el desarrollo de MAdLandExpression, una plataforma genómica interactiva que reúne los datos de expresión génica obtenidos en el estudio.
La herramienta, construida con EasyGDB, organiza y pone a libre disposición los conjuntos de datos generados para Spirogyra y otras plantas sin semillas. Ofrece gráficos interactivos y herramientas de comparación para que investigadores de todo el mundo puedan explorar la actividad de sus genes.
Quién firma el trabajo
La investigación está liderada por científicos de las universidades alemanas de Göttingen y Freiburg, con la participación del equipo de La Mayora. Los resultados se han publicado en The Plant Cell.
Cómo consultar los datos
Los conjuntos de datos de expresión génica están disponibles de forma libre en la plataforma MAdLandExpression, accesible a través de la web del proyecto.
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